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| チーム名 | 選手名 | チーム名 | 選手名 |
| 横浜 | 古木克明内野手（豊田大谷） | 西武 | 松坂大輔投手（横浜高） |
| 中日 | 福留孝介内野手（日本生命） | 日本ハム | 実松一成捕手（佐賀学園） |
| ヤクルト | 石堂克利投手（愛工大名電高） | 福岡ダイエー | 吉本 亮内野手（九州学院高） |
| 巨人 | 上原浩治投手（大体大） | オリックス | 新垣 渚投手（沖縄水産高） |
| 広島 | 東出輝裕内野手（敦賀気比高） | 近鉄 | 宇高伸次投手（近畿大） |
| 阪神 | 藤川球児投手（高知商高） | 千葉ロッテ | 小林雅英投手（東京ガス） |
☆：後にカープに在籍
ドラフト２位指名選手
| チーム名 | 選手名 | チーム名 | 選手名 |
| 横浜 | 矢野英司投手（法政大） | 西武 | 赤田将吾内野手（日南学園高） |
| 中日 | 岩瀬仁紀投手（ＮＴＴ東海） | 日本ハム | 建山義紀投手（松下電器） |
| ヤクルト | 牧谷 宇佐美投手（旭川実業高） | 福岡ダイエー | 松 修康投手（東北福祉大） |
| 巨人 | 銭岡智宏内野手（近畿大） | オリックス | 川越英隆投手（日産自動車） |
| 広島 | 井生崇光内野手（東筑高） | 近鉄 | 藤井彰人捕手（近畿大） |
| 阪神 | 金沢健人投手（ＮＴＴ関東） | 千葉ロッテ | 里崎智也捕手（帝京大） |
☆：後にカープに在籍
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